O Batalhão de Operações Especiais participa ostensivamente de ação conjunta com diversos órgãos de Segurança Pública, tais como: Polícia Federal, Polícia Civil, Polícia Rodoviária Federal, Receita Federal e Agência Brasileira de Inteligência. A Operação tem como objetivo atuar nas áreas fronteiriças agindo contra o crime organizado, visando coibir o abigeato, o tráfico de pessoas, de armas, de droga e de animais, também o contrabando e descaminho, entre outros crimes.